研究报告

陆地棉GhC4H基因家族分析  

夏成林 , 于月华 , 张承琪 , 陈全家 , 倪志勇
新疆农业大学农学院,乌鲁木齐, 830052
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2019年04月18日    接受日期: 2019年05月18日    发表日期: 2020年06月22日
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摘要
肉桂酸 -4- 羟化酶(C4H)是苯丙烷代谢途径途径的一个重要的调控酶,在植物木质素的合成中起 着重要作用。本研究通过对陆地棉基因组数据进行筛选,共鉴定得到 4个GhC4H 基因成员,分析发现所有成 员均属于碱性蛋白质,氨基酸数目均为 505,具有相似的理化性质、等电点和分子量等性状。进化树分析表明 植物 C4H蛋白主要分为两类。陆地棉 4个 GhC4H 基因成员均分布于染色体的正链下方,亚细胞定位均在细 胞质膜上。4个GhC4H启动子序列中均有MBS顺式作用元件,只有一个成员没有AC顺式作用元件。4个 GhC4H 基因之间的Ka/Ks 值均小于0.5,表明在进化过程中比较保守。通过转录组数据分析发现 4个GhC4H 基因在叶中相比其他组织中的表达量高,随着棉花纤维的发育 4个 GhC4H 基因变化趋势均是从高到低。本 研究为揭示陆地棉 GhC4H基因家族的生物学功能提供了理论参考。
关键词
陆地棉(Gossypium hirsutum);C4H;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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